Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SprtnG3X912 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms