Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms