Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms