Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D430041D05RikF6ZGR6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms