Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Crocc2F6XLV1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crocc2F6XLV1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crocc2F6XLV1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms