Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp988F6VKC7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp988F6VKC7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms