Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm1979E9QAN3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm1979E9QAN3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms