Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms