Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930451I11RikE9Q9R3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms