Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc141E9Q8Q6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc141E9Q8Q6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms