Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms