Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Simc1E9Q6E9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms