Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ythdc1E9Q5K9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms