Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17728E9Q5K2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17728E9Q5K2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms