Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms