Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20518E9Q548 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms