Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ApobE9Q414 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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