Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930579F01RikE9Q3L6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms