Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms