Protein–RNA interactions for Protein: E9Q365

Vmn1r101, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r101E9Q365 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r101E9Q365 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Vmn1r101E9Q365 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r101E9Q365 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r101E9Q365 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r101E9Q365 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms