Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms