Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hectd4E9Q2E4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms