Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc4E9Q236 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc4E9Q236 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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