Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Zfp558E9Q1J0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Zfp558E9Q1J0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Zfp558E9Q1J0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp558E9Q1J0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Zfp558E9Q1J0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Zfp558E9Q1J0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Zfp558E9Q1J0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Zfp558E9Q1J0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms