Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ryr1E9PZQ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ryr1E9PZQ0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms