Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Herc1E9PZP8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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