Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd2E9PZM4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms