Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rsph10bE9PYQ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rsph10bE9PYQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms