Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3002E9PW72 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3002E9PW72 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3002E9PW72 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3002E9PW72 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms