Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc62E9PVD1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms