Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prrt2E9PUL5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt2E9PUL5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms