Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms