Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms