Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms