Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm4950D3YUM8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm4950D3YUM8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm4950D3YUM8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm4950D3YUM8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm4950D3YUM8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm4950D3YUM8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm4950D3YUM8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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