Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms