Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms