Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cttnbp2B9EJA2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms