Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20547B8JJN0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gm20547B8JJN0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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