Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6133B2RY53 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms