Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap58B2RW38 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms