Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clrn2B2RVW2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clrn2B2RVW2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms