Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata6lB2RV46 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata6lB2RV46 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms