Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usf3B2RUQ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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