Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms