Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brpf3B2KF05 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms