Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CK137956B1AYM9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CK137956B1AYM9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms