Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scml2B1AVB3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms