Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssxa1B1AUS7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxa1B1AUS7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxa1B1AUS7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms