Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms